タンパク質立体構造情報データベースシステム PSILO
株式会社モルシス
この製品について
■PSILO (Protein SILO)
カナダ CCG社製 PSILOは、生体高分子やタンパク質-リガンド複合体構造情報のデータベースシステムです。公共データやin-houseデータなどの分散するタンパク質立体構造データを統合し、ウェブベースのインターフェースから容易にアクセスすることができます。類似ポケット検索や3D相互作用検索など、立体構造情報を用いた検索を行うことができます。 機能■検索
・高速なテキスト検索 ・タンパク質/抗体アミノ酸配列検索 ・類似ポケット構造検索 ・3D相互作用検索 ・化合物部分構造・類似構造検索■タンパク質立体構造の重ね合わせ
・タンパク質立体構造全体の重ね合わせ ・ポケット類似性による重ね合わせ ・リガンド構造による重ね合わせ ・重ね合わせ構造における相互作用の比較 ・重ね合わせ構造のMOEへの読み込み■データ表示
・リガンド結合部位の2D/3D表示 ・電子密度図の描画 ・タンパク質機能部位のアノテーション ・アミノ酸配列のアノテーション■データ更新とバージョンコントロール
・PDBデータの自動更新 ・in-houseデータの簡単な登録 ・タンパク質機能部位のアノテーション ・コメントフォーラム-
シリーズ
タンパク質立体構造情報データベースシステム PSILO
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取扱企業
株式会社モルシス
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カテゴリ
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タンパク質立体構造情報データベースシステム PSILO 品番1件
| 商品画像 | 品番 | 価格 (税抜) | 動作環境 OS | CPU | RAM | ストレージ | ネットワーク環境 | データベースサーバー | ウェブサーバー | プログラム実行環境 | 各種ライブラリー | アプリケーション | Webブラウザ |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PSILO |
要見積もり | 64bit Linuxサーバー | Intel Xeon 3.0 GHzマルチコア 16コア | 1コアあたり4GB以上、合計64GB以上 | 4RB以上の空き容量。RAID,LVM,ZFSなどの冗長構成。インハウスデータ、AlphaFoldデータを入れる場合は相応の追加ストレージが必要。SSDを推奨。 | 高速かつ高信頼性のネットワーク環境および、FTPによるPDBデータのダウンロード環境 | MySQL 8.0.16 | Apache 2.4.46以上、またはPHP 7ドキュメント対応のウェブサーバー。 | PHP 7.3.3以降 |
libcurl/libxml2/OpenLDAP/OpenSSL/ Zlib/JSMol 14.30.00/NGL Viewer 2.0.0-dev37/JQuery 1.10/ 他 |
MOE/batch 1トークン以上 |
Chrome、Edge、Firefox、Safariなど (HTML5/CSS3に対応したもの) |
のついている項目名や値は、Metoreeの自然言語処理アルゴリズムを用いて自動生成された値です。各メーカーの製品を横断して比較しやすくするための参考としてご利用ください。自動生成データは黒色の文字、元データは灰色の文字です。
