全てのカテゴリ

閲覧履歴

分子動力学 地球最速のオープンソース分子動力学計算プログラム Gromacs-Gromacs
分子動力学 地球最速のオープンソース分子動力学計算プログラム Gromacs-HPCシステムズ株式会社

分子動力学 地球最速のオープンソース分子動力学計算プログラム Gromacs
HPCシステムズ株式会社



無料
見積もり費用は無料です、お気軽にご利用ください

電話番号不要
不必要に電話がかかってくる心配はありません

この製品について

■製品概要

GROMACSはオランダ・フローニンゲン大学で開発され、現在はスウェーデン・王立工科大学とウプサラ大学のGROMACS開発チームにより開発されている分子動力学 (MD) 計算プログラムです。地球上で最速のMD計算プログラムを目指しており、MPIあるいはスレッド、GPUでの効率のよい並列計算を用いて高速処理が可能です。 フリーソフトウェアであり、GNU GPLライセンスに基づいて自由に改変可能であることも特徴です。生体高分子を対象としていますが、国内でも生命科学・医療、創薬分野にも適用事例が増えてきました。

■シミュレーション

・シミュレーション (分子動力学、ランジェバン動力学) ・エネルギー最小化 (共役勾配法、最急降下法) ・基準振動解析 ・相関関数

■アンサンブル

・Weak Coupling法 (温度・圧力制御) ・Nose-Hoover法 (温度制御) ・Parrinello-Rahman法 (圧力制御) ・Martyna-Tobias-Tuckerman-Klein法 (温度・圧力制御)

■長距離相互作用の取り扱い

・カットオフ近似 (Group based、twin-range、スイッチング関数、シフト関数) ・PME (particle mesh Ewald) ・PPPM (particle-particle particle mesh Ewald) ・Reaction Field ・ユーザ定義テーブル関数

■自由エネルギー計算

・熱力学的積分法 (thermodynamic integration) ・自由エネルギー摂動法 (free energy perturbation) ・試験粒子挿入法 (test particle insertion) ・レプリカ交換法 (replica exchange) ・GROMACS 5.0の変更点

  • シリーズ

    分子動力学 地球最速のオープンソース分子動力学計算プログラム Gromacs

この製品を共有する


最新の閲覧: 18時間前


無料
見積もり費用は無料のため、お気軽にご利用ください

電話番号不要
不必要に電話がかかってくる心配はありません

分子動力学 地球最速のオープンソース分子動力学計算プログラム Gromacs 品番1件

商品画像 品番 価格 (税抜)
分子動力学 地球最速のオープンソース分子動力学計算プログラム Gromacs-品番-Gromacs

Gromacs

要見積もり

この商品を見た方はこちらもチェックしています

多変量解析ソフトをもっと見る

HPCシステムズの取り扱い製品

HPCシステムズの製品をもっと見る

この商品の取り扱い会社情報

会社概要

HPCシステム株式会社は、高性能計算機の開発・製造・販売を行う企業です。 会社設立は2006年で、本社は東京都港区にあります。2022年3月時点での資本金は2億2461万円です。 主な事業内容は2つあります。1つはH...

もっと見る

  • 本社所在地: 東京都
Copyright © 2024 Metoree