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創薬支援ソフトウェア myPresto用インターフェース MF myPresto v3.5-MF myPresto
創薬支援ソフトウェア myPresto用インターフェース MF myPresto v3.5-株式会社フィアラックス

創薬支援ソフトウェア myPresto用インターフェース MF myPresto v3.5
株式会社フィアラックス

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この製品について

myPrestoは、AMED、経済産業省及びNEDOからの委託を受けて実施した、プロジェクトの中で開発された分子シミュレーションのプログラム群です。 医薬品開発支援のために作成された分子シミュレーション計算のプログラム群であり、化合物の二次元構造を三次元構造に変換し、タンパク質などのモデリング、タンパク質-薬物のドッキング、in silico スクリーニングを従来に比べて短時間で高精度・高能率に行うことができます。

■myPrestoの成果

・インフルエンザウイルスのRNAポリメレースPA-PB1複合体阻害剤 (横浜市立大学・朴先生と共同) ・μオピオイド受容体アゴニスト (A社と共同) ・農薬 (B社と共同) ・プロスタグランジンD2合成酵素阻害剤 (大阪大学、井上先生との共同) ・抗マラリア薬 (大阪大学井上先生との共同) ・cMet蛋白質複合体抗がん剤 (金沢大学　松本先生と共同) ・TNF-α転換酵素阻害剤 (C社と共同) ・ハンチントン病、ダウン症関連蛋白質複合体阻害剤 (横浜市立大学、西村先生) ・エピゲノム関連蛋白質 (東京大学先端研、児玉先生) ・その他、合計11標的蛋白質に対して200以上の新規活性化合物を3～50%のヒット率で発見。 通常、計算機スクリーニングは扱う対象の半数でしか有効でなく、またヒット率も最大10%とされる。myPrestoはほとんど外すことなく扱った標的に対してヒット化合物を発見し、10%台のヒット率を頻繁に記録している。タンパク、タンパク複合体阻害剤のような難しい標的で成功している。

■分子編集機能

・PDBIDによるファイルのダウンロード ・原子座標の並進、回転移動 ・原子データのコピー/カット/ペースト ・分子構造のクリッピング表示 ・リガンドの新規作成と編集 ・残基編集 ・水素原子や欠損原子の追加 ・溶媒付加 ・カウンターイオン付加 (生理食塩水濃度) ・トポロジーファイルの作成

■ドッキングシミュレーション

・リガンドフレキシブルドッキング ・受容体ポケットの位置をグラフィカルに指定可能 ・マウスクリックによるプローブ点の削除 ・複数のリガンドを1度にドッキング計算し結果を描画 ・受容体ポケット/グリッドポテンシャル/リガンドの構造データをファイル出力 ・ドッキングの結果のソート ・不要な結果の削除

  • シリーズ

    創薬支援ソフトウェア myPresto用インターフェース MF myPresto v3.5

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創薬支援ソフトウェア myPresto用インターフェース MF myPresto v3.5 品番1件

商品画像 品番 価格 (税抜) OS CPU メモリ ハードディスク ネットワーク
創薬支援ソフトウェア myPresto用インターフェース MF myPresto v3.5-品番-MF myPresto

MF myPresto

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Windows 10/11 Mac OS X 10.13以降 Rocky Linux 8/9 Red Hat Enterprise Linux 8/9

Intel Core 2 2.0GHz 同等以上

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200MB以上 ただし、計算出力保存用に別途数百GB

Gigabit Ethernet

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