ゲノム配列決定とリファレンスデータ作成
株式会社メイズ

🧬 バイオ業界用 🏥 医療業界用 💊 製薬・医薬品業界用

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この製品について

Long read 配列をAssembleすることで、染色体レベルのContig配列を得ることができるようになっています。
しかしながら、生物種やDNA抽出の条件などで、期待通りの結果が得られない場合があります。
そのよな課題に取り組みながら、実験に有効利用できるリファレンスデータを作成します。
また、そのデータを検索参照できるWebシステムも提供いたしますｓ。

■  リファレンスデータ取得に関するコンサルティングご研究の目的や抽出可能なサンプルの状態、さらにご予算を考慮して、リファレンスデータ取得の計画についてご提案いたします。

■  シーケンシング受託Long read シーケンシングを受託でお受けします。
trio解析用のDNAシーケンシングや遺伝子予測とAssembled-mRNA配列取得のためのRNA-seqもお受けいたします。

■  アセンブルの実施と評価Long read 配列を評価して、その後、Assembleを行います。
得られたContig配列についても評価を行います。

■  遺伝子予測と予測結果の評価ゲノムContig配列から遺伝子を予測します。

■  予測遺伝子にアノテーションを付与  Orthologデータベースを使用して、アノテーションを付与します。
GFFファイルにアノテーション情報挿入します。

■  Assembled-mRNA作成とアノテーションの付与RNA-seq read 配列をアッセンブルし、Assembled-mRNA作成します。
また、この配列にアノテーションを付与します。
加えて、ゲノム配列にmappingして、GFFファイルを作成します。

■  遺伝子カタログWebシステム「Ansrch」の作成作成したリファレンスデータをWebシステムで参照できるようにします。