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タンパク質立体構造の表示・解析用ソフトウェア Waals スタンダード版-Waals スタンダード版
タンパク質立体構造の表示・解析用ソフトウェア Waals スタンダード版-株式会社アルティフ・ラボラトリーズ

タンパク質立体構造の表示・解析用ソフトウェア Waals スタンダード版
株式会社アルティフ・ラボラトリーズ

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この製品について

■直観的な操作で、すぐに使える -- 表示・作図・動画機能

・蛋白質、DNA/RNAの各種表示形式での表示 ・操作：立体構造とアミノ酸配列の連動操作、状態をWaals書類で保存 ・表示：ステレオ表示、複数ファイルに対応した画面分割・切替え表示、自動回転 ・作図支援：ラベル、距離表示、点線、Depth Cueing、Transparent ・Workspace機能：選択部分を取り出して切替え表示 ・立体構造上での原子間距離の測定、距離による選択 ・動画自動生成：作成した図から回転や揺れ等の動画を自動生成 ・PDBフォーマット編集：二次構造のアサイン (DSSP) 、アミノ酸残基の登録、構造の削除

■調べる機能が充実　-- 距離による検出・重ね合わせ (スタンダード版のみ)

・タンパク質、DNAの重ね合わせ： 自動重ね合わせ、Superimpose (残基指定、原子指定) ・蛋白質立体構造の比較： 類似構造の自動検出、RMSDの算出 ・相互作用の解析支援：蛋白質ー蛋白質間、蛋白質ーリガンド間の原子間距離に基づく近傍残基の検出、距離による色分け表示 ・マージ機能：重ね合わせに基づく立体構造の取り込み

■Waals スタンダード版：調べる・比較する

■重ね合わせて比較する

自動的に重ね合わせるAuto-Fitと、指定した残基や原子単位で重ねるSuperimpose。重なり合う残基数やRMSDを算出し、立体構造の類似性を数値で比較することができます。

■変異の影響を調べる

SWISS-MODEL等で得られた変異体モデルを野生型と比較すれば、構造上の違いが明確に。変異の位置や、周辺の構造を調べるのもWaalsなら簡単です。

■低分子との結合部位を調べる

リガンドや阻害剤とタンパク質との間で、指定した距離内にある残基を抽出できます。距離により色分けで表示し、原子間の距離を表形式で出力します。結合に重要な残基を検出できます。

■タンパク質の相互作用を調べる

タンパク質間やDNA/RNAとタンパク質との間で、指定した距離内にある残基を抽出し、原子間の距離を表形式で出力します。抗原と抗体や、受容体とリガンド等でインタフェースを網羅的に検出できます。

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    タンパク質立体構造の表示・解析用ソフトウェア Waals スタンダード版

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  • 本社所在地: 東京都
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