¿Qué es un Sistema de Extracción de Ácido Nucleico?
Los ácidos nucleicos son el ADN y el ARN utilizados para dilucidar el sistema genético.
Los ácidos nucleicos de animales y plantas se utilizan para dilucidar el sistema genético, investigar las causas de las enfermedades y para la investigación del genoma.
Existen muchos métodos de extracción de ácidos nucleicos, pero el método de fenol/cloroformo, que se ha utilizado durante mucho tiempo, es difícil de manejar como reactivo, y la eliminación del líquido residual también es difícil.
Sin embargo, incluso con kits de extracción, el procesamiento de grandes cantidades de muestras requiere una enorme cantidad de tiempo y mano de obra, por lo que se han desarrollado sistemas de extracción de ácido nucleico para automatizar la operación.
Los sistemas de extracción de ácido nucleico se utilizan en instituciones médicas y con fines de investigación, ya que procesan automáticamente grandes cantidades de muestras una vez que éstas y los reactivos y cartuchos incluidos en los kits especiales se han colocado en la unidad principal.
Existen varios tipos de sistemas de extracción de ácido nucleico. El tipo de ácido nucleico que se puede procesar, el número de muestras y el tiempo de extracción difieren, por lo que es importante seleccionar el adecuado para cada fin.
Usos de los Sistemas de Extracción de Ácido Nucleico
Dado que pueden procesar un gran número de muestras en poco tiempo, son utilizados por instituciones y laboratorios que realizan pruebas genéticas. En el caso de los virus de la gripe y los virus RS, todas las instituciones médicas están equipadas con kits de diagnóstico sencillos y las pruebas de PCR (en inglés: Polymerase Chain Reaction) no son necesarias.
Sin embargo, para el coronavirus, por ejemplo, aún se han desarrollado pocos kits de diagnóstico fiables y sencillos. Por lo tanto, es necesario extraer el ARN del virus para realizar una prueba PCR en el paciente.
Según el modelo, estos sistemas de extracción de ácido nucleico pueden extraer desde unas pocas hasta 96 muestras en tan sólo 60 minutos. Los volúmenes de muestra que se pueden procesar varían entre unos 100 µl y 5 ml.
Principio de los Sistemas de Extracción de Ácido Nucleico
Existen varios métodos de extracción de ácidos nucleicos, pero el método utilizado actualmente consiste principalmente en adsorber ADN o ARN en una resina de intercambio aniónico o en un filtro de membrana de sílice y eluirlos ajustando la concentración de sal y el pH.
Los kits de extracción específicos vendidos por QIAGEN utilizan este principio. Los sistemas de extracción de ácido nucleico utilizan el método de membrana de sílice y, cambiando los kits y protocolos correspondientes, puede purificar automáticamente ADN plasmídico, ADN genómico, ácidos nucleicos virales, ARN e incluso proteínas.
Están equipados con funciones de centrifugado, calentamiento, agitación y pipeteo y utilizan un brazo robótico para realizar la extracción. En funcionamiento, la muestra se disuelve primero y se adsorbe en una columna de centrifugación con una membrana de sílice.
A continuación, el filtro de membrana de sílice se lava con los reactivos suministrados con el kit y, por último, se eluyen los ácidos nucleicos de interés. No hay arrastre y una función de comprobación de la carga garantiza que la muestra, los reactivos y los tubos se cargan correctamente.
El tipo de ácidos nucleicos que pueden procesarse, el número de muestras y el tiempo de extracción varían en función del modelo. Este sistema de extracción de ácido nucleico de QIAGEN puede extraer ADN desde 100 pb hasta 10 kbp.