相同性検索・系統解析ソフトウェア 微生物同定システム ENKI®
株式会社テクノスルガ・ラボ
この製品について
■概要
当社では国立遺伝学研究所生命情報DDBJセンターのご支援により、微生物同定に有効なデータを収集したDNAデータベース「微生物同定データベース」を構築し、当社が開発した簡単に系統解析を可能とする微生物同定ソフトウェア「ENKI®」とあわせて販売しています。
本システムは、解析メニューのボタンが解析手順に沿って並んでおり、専門知識のないお客様でも簡単に操作可能です。また、解析したい塩基配列を複数選択し、相同性検索から系統解析までを自動で行うことも可能です。
微生物同定データベースは、基準株および学術論文などを参考に精査したDNA塩基配列データで構成されています。バージョンアップは定期的に行い、新種提唱された種の基準株やタイプ由来株のDNA塩基配列データを追加するほか、国際塩基配列データベースに未登録の種の基準株やタイプ由来株については、必要に応じて当社が独自にDNA塩基配列を解析し、微生物同定データベースに追加しています。
細菌・菌類の2種類のデータベースを用意しており、細菌のデータベースは既知種の80%以上の基準株をカバー 。(17,000種以上)
■機能一覧
1.複数塩基配列の一括読込
複数の塩基配列データの一括読込が可能 (ドラッグアンドドロップで入力可能) 。
2.ユーザーデータベース
・お客様独自のデータベース構築が可能。
・検索対象にご選択いただくことより、相同性検索から系統樹作成までの解析が可能。
3.複数のデータベースに対する相同性検索
当社が構築した「微生物同定データベース」に対する相同性検索に加え、お客様が構築したユーザーデータベースも併せて指定することで、同時解析が可能。 (過去のデータと比較解析可能)
4.マルチプルアライメント/系統樹作成
・複数の任意配列を加えての系統解析が可能。
・ユーザーデータベースのデータも解析可能。
・アウトグループを自動選択にすれば、どなたでも系統樹作成が可能。
5.自動解析
・複数のデータを選択し、相同性検索から系統樹作成まで自動解析が可能。
・専門的な知識不要の自動解析機能搭載 (分子系統解析まで実施)
6.インターネット BLAST
・インターネットに接続できる環境下で、国際塩基配列データベースに対する相同性検索が可能。
・バイオセーフティレベル出力により、安全性評価が簡単。
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シリーズ
相同性検索・系統解析ソフトウェア 微生物同定システム ENKI®